Suite à un soucis de changement de colorimétrie suite à une conversion, j'ai trouvé comme solution d'utiliser haldclutsrc.
Il faut faire comme commande :
-filter_complex haldclutsrc=8[clut],[0][clut]haldclut=shortest=1

Source de la réponse :
https://trac.ffmpeg.org/ticket/3751