Suite à un soucis de changement de colorimétrie suite à une conversion, j'ai trouvé comme solution d'utiliser haldclutsrc.
Il faut faire comme commande :
-filter_complex haldclutsrc=8[clut],[0][clut]haldclut=shortest=1

Source de la réponse :
https://trac.ffmpeg.org/ticket/3751

La manipulation est assez simple; en grande partie expliqué sur ce site : http://www.deb-multimedia.org/

Il faut d'abord modifier le fichier /etc/apt/sources.list (avec "nano" par exemple).
Rajouter : deb http://www.deb-multimedia.org jessie main non-free
(ligne pouvant être différente, allez sur le site pour choisir votre version)

Ensuite faire :
apt-get install deb-multimedia-keyring
apt-get update
apt-get dist-upgrade
apt-get install ffmpeg

On met à jour les dépôts, puis installe les dépendances, et enfin on installe FFmpeg.